.DS_Store はmacOSがフォルダ表示設定などを保存するためのファイルです。__MACOSX はmacOS由来のメタ情報がZIPに含まれたときに作られることがあります。
作品ファイルではない
これらは多くの場合、納品物として必要なファイルではありません。受け取り側がWindows環境の場合、見慣れないファイルとして表示され、どれを使えばよいか迷わせてしまうことがあります。
混入しやすい場面
FinderからそのままZIPを作ると、環境や作り方によって混ざることがあります。特に複数フォルダをまとめた納品や、何度も圧縮し直したZIPでは確認しておくと安心です。
対応
納品前にZIPの中身を確認し、不要なシステムファイルが入っていない状態で作り直します。納品ZIPチェッカーでは、これらを「問題あり」として表示します。